Макото Ито — обычный японский школьник, который не выделяется на фоне своих сверстников. Его жизнь проходит в спокойном ритме, и он предпочитает не привлекать к себе лишнего внимания. Но внутри него бурлит море эмоций — особенно когда дело касается Котонохи, симпатичной одноклассницы, с которой он невольно сталкивается каждое утро в поезде. Несмотря на сильное влечение к ней, Макото испытывает трудности с тем, чтобы завести разговор. Его застенчивость мешает ему выразить свои чувства, и он остаётся в тени своих мечтаний. Однако в жизни Макото происходит неожиданный поворот, когда к его ситуации подключается энергичная одноклассница, Сэкай Сайондзи. Видя, как Макото страдает от неразделённой любви, она решает вмешиваться и помочь своему соседу по парте найти счастье в любви. Сэкай — это полная противоположность Макото: она уверена в себе, коммуникабельна и не боится действовать. Своими усилиями она пытается преобразовать его образ жизни, подталкивая к тому, чтобы он наконец открылся и обратил внимание на свои чувства. Сначала поддержка Сэкай кажется многообещающей, и, казалось бы, всё должно идти в лучшем направлении. Она становится своего рода связующим звеном между Макото и Котонохой. Однако вскоре отношения начинают усложняться, когда возникают непредвиденные обстоятельства. Все три героя оказываются вовлечёнными в сложный треугольник, наполненный недопониманием, ревностью и неожиданными поворотами судьбы. С каждым днём Макото всё больше осознаёт свои истинные желания и внутренние конфликты между долгожданной любовью и дружбой. Sэкай, несмотря на свои намерения помочь, тоже начинает испытывать чувства к Макото, что лишь усложняет ситуацию. Все трое персонажей вынуждены разобраться в своих эмоциях, что гармонично отображает реальную природу подростковых отношений. Фильм пронизан волнующими моментами, радостными и грустными, которые заставляют героев переосмыслить свои поступки и роли в жизни друг друга. Таким образом, «Школьные дни» — это история о любви, дружбе и поиске себя, которая показывает, как сложно бывает выразить свои чувства и принимать нелёгкие решения. Каждый из героев должен пройти через свой путь самопознания, чтобы понять, что действительно важно для них.